Dem IZG gehören Professor*innen, wissenschaftliche und nichtwissenschaftliche Mitarbeiter*innen sowie Studierende an. Die Mitarbeit im IZG steht allen in der Geschlechterforschung engagierten Studierenden, Lehrenden und Forschenden offen.
Das IZG wird von einem Vorstand geleitet. Diesem gehören Professor*innen aus unterschiedlichen Fakultäten der Universität Bielefeld an. Ein wissenschaftlicher Beirat berät den Vorstand. Er wird für eine Amtszeit von vier Jahren gewählt.